Tras 2 temporadas en la segunda división, salió campeón en la edición 1999-00, por lo que vuelve a la 1.Bundesliga para la temporada 2000-01, donde no pasó del décimo lugar. Cabe destacar a los porteros internacionales Harald Toni Schumacher y Bodo Illgner, al centrocampista Wolfgang Overath, quien ostentó la presidencia del club entre 2004 y 2011, o a los delanteros Lukas Podolski, Dieter Müller, Pierre Littbarski o Hans Schaefer. Sus largos trayectos por las bandas y sus persistentes regates, al final, camiseta del juventus no le permitieron aclarar sus ideas y concretar acciones.